内镜中心担负全院临床消化内镜检查、诊断和镜下介入微创治疗工作，配置有当今最先进的系列电子消化内镜和图像处理装置。包括高分辨率、放大(H)、荧光成像(AFI)和窄带成像(NBI)电子胃镜，放大(H)及硬度可变电子肠镜，诊疗电子十二指肠镜及普通常规检查电子胃肠镜10余条。还有先进的高频电凝切治疗装置和氩气刀手术设备。内镜主机系统4套，可同时进行常规内镜及无痛内镜检查及治疗。现代化内镜洗消设备和检测设备先进可靠，内镜的检查治疗操作及器械的清洗消毒认真遵守国家操作规范，一人一镜彻底洗消，严格执行一次性器械使用的有关规定 。
　　内镜中心有舒适的侯诊和医疗环境，分设普通胃镜室2间、普通肠镜室2间、无痛内镜室2间、洗消室2间、储镜室1间、功能检测室1间和恢复室1间等。根据诊疗功能的需要均配置了先进完善的诊疗和监护设备。
　　内镜中心医护人员主动与相关临床科室协作医疗，积极开展肿瘤的早期及中晚期的联合诊断和治疗。内镜检查和治疗均由经过国家专业培训基地进修资质合格的，并具有多年临床消化病及消化内镜诊治经验的高年资医师亲自操作。现有3名主任医师和教授主诊治。　　特别是能保证对每一位患者进行首诊全程诊疗负责制，并开辟住院进一步诊治的绿色通道，保证患者诊疗全程的及时有效和高水平、高质量。
　　常规内镜检查：包括食管、胃、十二指肠、直肠、乙状结肠及全结肠的检查，急诊内镜检查等。
　　无痛内镜检查：以麻醉或镇静的方式，让患者在安全、舒适和无痛苦的状态下平静接受检查。恢复室设观察床4张，麻醉监护设备固定齐全。
　　十二指肠镜逆行胰胆管造影（ERCP）和乳头肌切除术（EST）：经十二指肠乳头插管进行胰、胆管造影的技术。进一步可放置鼻胆管、胆道内支架等进行引流进一步微创治疗，还可进行胆管结石的取石、梗阻性黄疸的减黄等微创手术。
　　内镜下色素染色活检术：主要用于标识界定、鉴别诊断消化道癌前病变和早癌，确定其病变范围，准备进一步治疗。并帮助动态观察病变消长过程及治疗效果判定。
　　内镜微创治疗技术：丰富多样。主要有：内镜下消化道早癌切除术及粘膜剥离术（ESD），内镜下息肉摘除术、内镜下异物取出术、内镜下消化道止血术（包括钛夹止血、注射止血、血管结扎）、食管及胃底静脉曲张硬化、栓塞及套扎术，内镜下消化道（食管、贲门、幽门及结直肠）良性及癌性狭窄扩张术和记忆金属支架置入术、内镜下肠梗阻管置减压术、内镜下消化道各种导管置放术等。
　　消化道功能及病原检测：进行消化道动力及排空功能测13C、14C呼气试验行无创幽门螺旋杆菌感染检测等。